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Text File  |  1995-03-04  |  2.0 KB  |  44 lines
  1. **********************************************************************
  2. * Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases class-I active site *
  3. **********************************************************************
  4.  
  5. The pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases are FAD flavoproteins which
  6. contains a pair of redox-active cysteines involved in the transfer of reducing
  7. equivalents from the FAD cofactor to the substrate.   On the basis of sequence
  8. and  structural similarities [1]  these enzymes  can  be  classified  into two
  9. categories. The first category groups together the following enzymes [2 to 5]:
  10.  
  11.  - Glutathione reductase (EC 1.6.4.2) (GR).
  12.  - Trypanothione reductase (EC 1.6.4.8).
  13.  - Lipoamide dehydrogenase (EC 1.8.1.4),  the  E3 component  of alpha-ketoacid
  14.    dehydrogenase complexes.
  15.  - Mercuric reductase (EC 1.16.1.1).
  16.  
  17. The sequence around the  two cysteines involved  in the redox-active disulfide
  18. bond is conserved and can be used as a signature pattern.
  19.  
  20. -Consensus pattern: G-G-x-C-[LIVA]-x(2)-G-C-[LIVM]-P
  21.                     [The two C's form the active site disulfide bond]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24.  
  25. -Note: in positions 6 and 7 of the pattern all known  sequences have Asn-(Val/
  26.  Ile) with the  exception of GR from plant chloroplasts and from cyanobacteria
  27.  which have Ile-Arg [6].
  28.  
  29. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  30.  
  31. [ 1] Kurlyan J., Krishna T.S.R., Wong L., Guenther B., Pahler A.,
  32.      Williams C.H. Jr., Model P.
  33.      Nature 352:172-174(1991).
  34. [ 2] Rice D.W., Schulz G.E., Guest J.R.
  35.      J. Mol. Biol. 174:483-496(1984).
  36. [ 3] Brown N.L.
  37.      Trends Biochem. Sci. 10:400-402(1985).
  38. [ 4] Carothers D.J., Pons G., Patel M.S.
  39.      Arch. Biochem. Biophys. 268:409-425(1989).
  40. [ 5] Walsh C.T., Bradley M., Nadeau K.
  41.      Trends Biochem. Sci. 16:305-309(1991).
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  43.      Plant J. 2:129-131(1991).
  44.